Languedoc, 1685. Sous l'influence de Mme de Maintenon, Louis XIV vient de révoquer l'Édit de Nantes : les protestants doivent se convertir – ou mourir. Déjà les premières dragonnades ont lieu dans les Cévennes : le marquis de Souvré, cruel et libidineux, massacre les habitants d'un village huguenot.
Pierre d'Aumelas, jeune seigneur de ce village martyr, décide de protester auprès du roi. Accompagné de son ami d'enfance Balthazar Herrero, descendant de ces Maures espagnols qui ont préféré l'exil à l'Inquisition, médecin déjà réputé malgré son jeune âge, il chevauche vers Paris – et s'amourache en chemin d'une belle demoiselle attaquée par des malandrins...
Mais obtenir une audience du roi est difficile. D'autant que Sa Majesté est malade : atteint d'une fistule à l'anus, ses jours semblent comptés. Aumelas tente d'arriver à ses fins en faisant intervenir le Grand Condé, auprès duquel il a jadis guerroyé en Flandres. Balthazar, lui, s'introduit auprès du médecin du roi, d'Aquin. Et c'est lui, Balthazar, qui guérira Louis XIV. Il en sera récompensé : une grande carrière s'ouvre à lui.
Duels, intrigues amoureuses, viols et violences, exécutions sanglantes, festins monstrueux : Soleil noir raconte l'envers du " Grand Siècle ", miné par les dissensions au plus haut de l'État, les ambitions de Louvois, la vieillesse de Condé et le froid intense du " petit âge glaciaire " qui frappe alors la France.